Ce cours est consacré au test statistique du logrank (appelé aussi le test du log-rank ou le test de Mantel-Cox) qui permet de comparer deux ou plusieurs courbes de survie. Cette vidéo montre un tutoriel pas à pas qui explique comment réaliser le test du logrank pour comparer deux courbes de survie, sur un exemple concret et illustré.

Est-ce que la différence entre ces deux fonctions de survie est significative ? Est-elle bien réelle, ou elle est peut-être due au hasard et au fait que les effectifs sont faibles ? Comment le savoir ? Le test du logrank nous permet justement de réponde à cette question.

Le principe de fonctionnement du test du logrank est basé sur la comparaison entre le nombre d’évènements observés et le nombre d’évènement attendus, sous l’hypothèse d’égalité de fonctions de survie. La statistique du test suit la distribution de chi-deux, ce qui nous permet de calculer la p-valeur associée au test.

Intervenant : Ekaterina Flin, ingénieur en informatique, groupe EpiMed, Institut pour l’Avancée des Biosciences (IAB), Université Grenoble Alpes (UGA)

#analyse_de_survie #logrank

Table des matières
00:00 Cancer du sein : la différence de survie est-elle significative ?
00:48 Présentation de l’exemple étudié dans ce cours
01:15 Formalisation du problème, l’hypothèse nulle du test
02:04 Signification de la p-valeur pour le test du logrank
02:57 Effectif de chaque groupe et données de survie censurées
03:45 Calcul du nombre de patients à risque
04:55 Calcul du nombre d’évènements (décès)
05:20 Calcul du risque instantané
05:52 Calcul du nombre d’évènements attendus
06:27 Comparer le nombre de décès attendus et observés
06:46 Calcul de la statistique du test de chi-deux
07:37 Principe du calcul de la p-valeur
08:10 Calcul de la p-valeur avec Python et scipy
09:14 Interprétation du résultat
10:29 Conditions d’application du test du logrank
11:16 Points clés à retenir et conclusions

Liens
Introduction à l’analyse de survie, courbe de Kaplan-Meier :    • Introduction à l’analyse de survie, c...  
Créer une courbe de survie de Kaplan-Meier avec Python :    • Créer une courbe de survie de Kaplan-...  

Article recommandé :
C.Alberti, J.-F.Timsit, S.Chevret. Mémento biostatistique. Analyse de survie : le test du logrank. Revue des Maladies Respiratoires. Volume 22, Issue 5, Part 1, November 2005, Pages 829-832.
https://doi.org/10.1016/S0761-8425(05...
https://www.sciencedirect.com/science...